Duizenden boeren nabij Natura 2000 gebieden dreigen in de problemen te komen omdat zij geen vergunning op grond van de Natuurbeschermingswet kunnen krijgen. Dat beeld doemde op bij de Raad van State die op 24 februari bezwaren tegen twee verleende vergunningen rond de Deurnese Peel behandelde. De staatsraad betoogde dat de twee veehouderijen bij de Deurnese Peel in zijn totaliteit beoordeeld hadden moeten worden omdat ze nog niet over een vergunning op grond van de Natuurbeschermingswet beschikten.
Er zijn veel veehouders die hun bedrijf zonder toetsing op de Natuurbeschermingswet hebben kunnen uitbreiden. Wanneer deze bedrijven alsnog in hun volle omvang moeten worden beoordeeld op grond van de strenge normen van de nieuwe Natuurbeschermingswet uit 2005, die zijn gebaseerd op de Europese Vogel- en Habitatrichtlijn, kan dat voor veel bedrijven in de omgeving van een Natura 2000 gebied een probleem geven.
De ingrijpende consequenties die voortvloeien uit de door de staatsraad geuite wetsinterpretatie gaan zelfs Werkgroep Behoud De Peel te ver. Bestuurslid Wim van Opbergen acht het onredelijk ten opzichte van boeren die in het verleden wél een Natuurbeschermingswetvergunning tegen de toen geldende, minder strenge normen hebben gekregen. De bezwaren van de milieuwerkgroep richten zich tegen de opstelling van de provincie Noord-Brabant die de hoeveelheid vee in milieuvergunningen van vóór 2005 als uitgangspunt neemt bij verlening van Natuurbeschermingswet vergunningen.